多肽裂解儀通過物理、化學(xué)或生物方法打斷多肽鏈中的肽鍵,將復(fù)雜蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化為可分析的肽段。多肽裂解儀其技術(shù)路徑主要分為三大體系:
酶解法
原理:利用生物酶(如胰蛋白酶、胃蛋白酶)的特異性切割能力,在溫和條件(如37℃恒溫)下精準(zhǔn)識別并斷裂特定氨基酸殘基(如賴氨酸、精氨酸)羧基端的肽鍵。
優(yōu)勢:裂解產(chǎn)物片段長度均一,適用于多肽序列分析、質(zhì)譜鑒定等場景。例如,胰蛋白酶可在16小時內(nèi)將牛血清白蛋白裂解為理論覆蓋度超80%的肽段混合物。
局限:對酶解條件(如pH、溫度)敏感,且難以處理含大量脯氨酸或修飾氨基酸的多肽。
化學(xué)裂解法
原理:通過強酸(如6M鹽酸)或強堿(如氫氧化鈉溶液)在高溫(100℃)條件下實現(xiàn)分子級斷裂,適用于難降解的膠原蛋白、角蛋白等。
優(yōu)勢:裂解效率高,可處理復(fù)雜樣本。
局限:反應(yīng)條件劇烈,可能導(dǎo)致非特異性斷裂或氨基酸側(cè)鏈修飾,需后續(xù)純化步驟。
物理裂解法
原理:利用激光(如193nm準(zhǔn)分子激光脈沖)在納秒級時間內(nèi)產(chǎn)生局部超高溫,使肽鍵發(fā)生非熱力學(xué)斷裂。
優(yōu)勢:無化學(xué)試劑殘留,適用于對化學(xué)污染敏感的樣本(如臨床診斷標(biāo)本)。
局限:設(shè)備成本高,操作技術(shù)要求嚴(yán)格。